Nombre: Shishio Makoto
Apodo: --

Edad: 30 años
Fecha de Nacimiento: Agosto de 1848
Arma: Kotetsu / Mugenjin
Estilo: --
Descripción: Makoto Shishio fue el sucesor de Battousai. Como era muy habil con la espada, se convirtió en una amenasa y fue traicionado por sus colegas, le dispararon numerosas veces y lo quemaron. Increíblemente sobrevivió y decidió vengarse del gobierno y crear su propia era. Pero él no podía hacerlo solo porque no podía moverse libremente por más de quince minutos por sus graves quemaduras que le impedían regular su temperatura corporal. Por eso, el Sr. Shishio creó el Juppongatana y una gran organización. Shishio intentó destruir Tokyo con el Rengoku (navío de guerra) e incendiar Kyoto, pero no logró ninguno de los dos. Shishio fue derrotado por Kenshin y murió por culpa de una combustión interna que se generó por la pelea contra Kenshin.
Nombre: Seta Sohjiro
Apodo: --

Edad: 18 años
Fecha de Nacimiento: Septiembre de 1861
Arma: Kikuichimonji norimune
Estilo: Tenbu no Sai Niyoru Ken
Descripción: Sohjiro tuvo un pasado bastante traumático. Como su "familia" lo trataba muy mal, él decidió esconder sus emociones y simpre estaba sonriendo. Él conoció a Shishio cuando era muy niño, Sohjiro fue afectado por las ideas de Shishio, especialmente porla siguiente: "Si eres fuerte vives, si eres débil mueres.". Shishio le regaló una espada y Sohjiro mató a toda su "familia" con ella... después siguió a Shishio para convertirse en el más fuerte. Por suerte, durante la pelea contra Kenshin, Sohjiro perdió el control de sus emociones y fue derrotado, después de eso, Sohjiro decidió abandonar a Shishio e ir en busca de su propia verdad. 
Nombre: Komagata Yumi
Apodo: --

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Daga
Estilo: --
Descripción: Yumi era una de las geishas más conocidas en Japón es esos tiempo y además era la amante de Shishio, por lo tanto, ella estaba profundamente enamorada de él. Durante la pelea contra Kenshin, ella trató de defender a Shishio, pero sólo logró que Shishio la matara para poder herir a Kenshin, bueno aunque a nosotros nos parezca extraño a ella le hizo feliz morir de esa manera.
Nombre: Sodojima Hoji
Apodo: --

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Shotgun
Estilo: --
Descripción: Hoji era la mano derecha de Shishio cuando se trataba de la organización o de generar planes. Hoji no tenía habilidades para la batalla, pero ayudaba a Shishio con su gran inteligencia. Hoji estaba medio loco y cuando murió Shishio su locura aumentó. Finalmente, terminó en la carcel y se suicidó porque no pudo defender al Sr. Shishio ante una corte.
Nombre: Yuukyuzan Anji
Apodo: Monje Depravado / Mio Ohanji

 

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Espada pequeña
Estilo: --
Descripción: Anji era un monje budista que perdió la fe cuando muchos de sus amigos fueron asesinados. Para crear su propia salvación, entrenó arduamente e inventó el Futae no Kiwami. Anji además se unió a Shishio para lograr esta salvación. Como Anji pensó que Sanosuke estaba de acuerdo con sus ideales, él le enseñó a utilizar el Futae no Kiwami. Mucho después, ambos pelearon y Sanosuke resultó el vencedor. Después de esta pelea, Anji volvió a ser el mimso de antes, pero de todas formas fue encarcelado.
Nombre: Sawagejo Chou
Apodo: Cazador de Espadas

 

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Renbatou / Hakujin no Tachi
Estilo: --
Descripción: Chou, el Cazador de Espadas, era parte del Juppongatana. Fue el primero en luchar contra Kenshin y fue vencido, aunque Kenshin no tuvo espada por casi 98% de la pelea. Chou fue encarcelado y fue el que avisó a Saito de que Shishio planeaba incendiar Kyoto. Chou tuvo varias pequeñas peleas sin sentido contra Sanosuke mientras estuvo en prisión. Después, él fue liberado y ayudaba a Saito a espiar para el gobierno.
Nombre: Unuma Usui
Apodo: Los Ojos del Corazón

 

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Lanza / Escudo
Estilo: Ryuukyuu
Descripción: Usui era un antiguo enemigo de Shishio. En esos tiempos, él fue vencido por Shishio y quedó ciego. Mucho tiempo después, se unió al Juppongatana de Shishio y tuvo que pelear contra Saito. Saito logró vencer a Usui y lo mató.
Nombre: Honjo Kamatari
Apodo: El Gran Kamatari de la Hoz

 

Edad: 29 años
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Hoz con cadena
Estilo: --
Descripción: Kamatari es uno del Juppongatana. Él amaba mucho a Shishio, por lo que terminó convirtiéndose en homosexual. Después de su derrota contra Kaoru y la muerte de Shishio, se convirtió en un espía del gobierno como estudiante de intercambio. 
Nombre: Saizuchi Roujin
Apodo: --

 

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: --
Estilo: --
Descripción: Saizuchi era el que controlaba a Fuji, por lo tanto, era parte del Juppongatana, Realmente no tenía ninguna habilidad física y fue vencido junto con Fuji por Hiko.
Nombre: Fuji
Apodo: --

 

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Espada (gigante)
Estilo: --
Descripción: Fuji era un humano extremadamente grande (aproximadamente el tramaño del EVA 01 de Neon Genesis Evangelion). Él al principio era como una marioneta que era controlada por Saizuchi, pero después Hiko le hizo ver que no lo necesitaba y Fuji reaccionó. A pesar de su tamaño, Fuji fue vencido por el Kuzu Ryu Sen de Hiko después de una pelea que dejó destruido gran parte del Aoiya y sus alrededores.
Nombre: Kariwa Henya
Apodo: El Henya Volador

 

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Explosivos
Estilo: Hikuu Hapa
Descripción: Henya era parte del Juppongatana. Él era muy flaco porque su técnica voladora así lo exigía. Él peleó contra Yahiko cuando estaba defendienfo el Aoiya y fue vencido.
Nombre: Iwambou
Apodo: --

 

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: --
Estilo: --
Descripción: Iwambou era uno del Juppongatana... no era muy inteligente. (advertencia, no leas el resto si no haz leido el Jinchuu Arc) Iwambou no era muy inteligente porque en serio era una marioneta controlada por Gein, al final Sanosuke se quedó con Iwambou y supongo que estará en el dojo Kamiya.
Nombre: Senkaku
Apodo: --

 

Edad: --
Fecha de Nacimiento: --
Arma: Nigirikai ken
Estilo: --
Descripción: Senkaku era uno de ls ayudantes de Shishio. Él había matado 99 personas y planeaba matar a Kenshin para llegar a la centena, pero obviamente no le pudo ganar. Shishio le dijo a Kenshin que si él no le enseñaba una de las técnicas del Hitten Mitsurugi maratía a Senkaku; por lo tanto, Kenshin lo hizo y le salvó la vida. Tiempo después, Senkaku fue asesinado por Sohjiro porque estaba a favor de Kenshin.